Fourier dönüşümü kızılötesi spektroskopisi ile CD133+/CD44+ prostat kanser kök hücrelerinin iki boyutlu ve üç boyutlu ortamdaki hücresel farklılıklarının belirlemesi

GIRIŞ ve AMAC: Sferoid kulturleri, hucrelerin kendi ic dinamikleri ve diger hucrelerle olan etkilesimleri acisindan tek tabakali kulturlere kiyasla tumor dokusunun ozelliklerini daha iyi yansitmaktadir. Bu calismanin amaci, uc boyutlu (3D) ve iki boyutlu (2D) kultur ortamlarinda uretilen CD133+/CD44+ prostat kanser kok hucrelerinin (KKH) makromolekullerindeki benzerlik ve farkliliklarinin arastirilmasidir. YONTEM ve GERECLER: DU-145 prostat kanser hucre hatti icerisindeki CD133+/CD44+ yuzey belirtec ozelliklerine sahip KKH’leri akis sitometrisi (FACS) kullanilarak izole edilmistir. Agarla kapli kultur kaplari ile sferoid yapilari olusturulmustur. 2D ve 3D kultur ortamlarindaki KHK hucreleri Fourier donusumu kizilotesi (FTIR) spektroskopisi ile karsilastirilmistir.  BULGULAR: CD133+/CD44+ hucrelerin birinci haftada agarli kultur ortamlarinda mikro-agregatlar olusturdugu gozlenmistir. Ikinci haftada ise, olgun sferoid yapilarin olustugu saptanmistir. 2D ve 3D (multiselluler tumor sferoidleri) kultur ortamlarinda uretilen hucreler ile yapilan FTIR analizleri KHK hucre yapisindaki proteinler, lipitler, karbonhidratlar ve nukleik asitlerde (DNA, RNA) onemli derecede farklanmalar oldugunu gostermistir. Membran lipit acil zincir uzunlugu ve hucre zari kalinligi, proteinlerin sekonder yapilari ve DNA oligonukleotitlerin baz sekanslarinda veya fonksiyonel gruplarinda onemli farklanmalarin oldugu tespit edilmistir. Elde edilen sonuclar, 3D kultur ortaminda uretilen sfreoid yapilarinin in vivo tumor dokusu ile benzer ozellikler sergiledigini gostermistir. TARTIŞMA ve SONUC: Hucre ortam kosullari ile yaratilmis olan fiziksel, kimyasal ve biyolojik ozellikler hucrelerin kendi ic dinamigini ve mikrocevresi icerisindeki etkilesimlerini onemli derecede etkilemektedir. 2D kultur ortamlari ile hucreleri tek boyutta indirgemek hucrelerin gercek ozelliklerini yansitmamaktadir. Bu nedenle, 3D kultur ortamlari ile hucre dinamiklerinin incelenmesi gerekmektedir. Bu calismadan elde edilen sonuclar, kanserde onemli bir hucre populasyonunu olusturan KKH’lerin membran yapisi, lipitler, proteinlerin sekonder yapilari ve DNA oligonukleotit yapilarinin terapotik hedef olabilecegini gostermektedir.