PIPELINE COMPUTACIONAL PARA O DESENHO DE PROTEÍNAS IMUNOGÊNICAS MULTI-EPITOPO DO VÍRUS NIPAH VISANDO O DESENVOLVIMENTO DE VACINAS

Introducao: O Nipah (NiV) e um virus zoonotico emergente pertencente a familia Paramyxoviridae que esta envolvido com doencas respiratorias e neurologicas fatais em humanos. O NiV representa um desafio para a saude publica com o risco potencial de disseminacao pandemica, bem como, aplicacao como agente de bioterrorismo. Metodologia: No presente estudo, usando metodos de imunoinformatica e modelagem molecular, desenhou-se modelos de proteinas multi-epitopos reconhecidos pelo sistema imunologico humano usando sequencias conservadas de cepas de NiV. Estes epitopos preditos foram selecionados de acordo com parâmetros fisico-quimicos, complementariedade e  afinidade de ligacao ao complexo principal de histocompatibilidade (MHC) classes I e II. Em seguida, essas cadeias polipeptidicas foram unidas usando linkers GPGPG, AAY e KK; e adjuvantes de β-defensina foram adicionados na estrutura com o proposito de aumentar a imunogenicidade. A antigenicidade, imunogenicidade, alergenicidade, bem como as propriedades fisico-quimicas das proteinas multi-epitopos desenhadas foram avaliadas usando algoritmos de aprendizado de maquina. Alem disso, simulacoes de docagem molecular foram realizados entre os modelos de proteina multi-epitopo com as estruturas do toll-like humano tipo 3 (TLR3), MHC-I e -II; em seguida, os complexos foram analisados ​​por simulacoes de dinâmica molecular e calculos de energia livre de ligacao para explorar a estabilidade dos complexos e suas afinidades de ligacao, respectivamente. Resultados: Os epitopos selecionados formaram interacao estavel com diferentes moleculas de HLA que cobrem mais de 98,0% da populacao humana em todo o mundo. Os modelos propostos mostraram-se potencialmente antigenicos e nao alergenicos e demonstraram alta afinidade e seletividade contra o TLR3. Alem disso, as sequencias de cDNA desenhadas mostraram-se compativeis com vetores de expressao de hospedeiros bacterianos, o que poderia facilitar sua expressao heterologa. Conclusao: Nossas analises computacionais forneceram evidencias sobre proteinas multi-epitopos biologicamente viaveis ​​para vacinas candidatas de proxima geracao contra o NiV e oferecem uma visao geral da imunogenicidade das proteinas NiV que podem ser usadas parao desenho de novos modelos multiepitopos com propriedades fisico-quimicas otimizadas.