儿童结核病结核分枝杆菌临床分离株中esxA、fbpB、Rv2660c基因多态性研究

目的对抗原编码基因esxA、fbpB、Rv2660c进行测序, 了解esxA、fbpB、Rv2660c的基因多态性。 方法选取135株结核分枝杆菌( Mycobacterium tuberculosis , MTB)临床分离株, 运用PCR方法扩增目的基因esxA、fbpB、Rv2660c并进行测序, 与结核标准株H37Rv基因序列以及从免疫表位数据库(immune epitope database, IEDB)中查询到的表位序列进行对比, 分析esxA、fbpB、Rv2660c基因序列中的变异特征。 结果在135株菌株中, esxA、Rv2660c序列暂未发现基因变异。fbpB共66株(48.89%)发现了基因变异, 5个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点共造成8个(14.81%)T细胞抗原表位以及9个(24.32%)B细胞抗原表位序列的多态性。fbpB基因的dN值为0.000 120, dS为0.002 126, 其中T细胞表位区与非T细胞表位区的dN值分别为0.000 067和0.000 408, dS分别为0.002 382和0.000 470, B细胞表位区dN和dS值分别为0.000 063和0.002 380, 非B细胞表位区dN和dS均为0。 结论esxA、Rv2660c基因序列较保守, fbpB存在基因多态性, 预测会对蛋白Ag85B的免疫功能造成影响, 从而影响H56的免疫有效性。