Dynamique de l’excrétion virale chez les patients infectés par le SARS-CoV-2

Introduction La duree de contagiosite d’un patient infecte par le SARS-CoV-2 n’est a ce jour pas encore clairement definie. Dans l’attente de nouvelles donnees, des recommandations sur les criteres de levees d’isolement (precautions gouttelettes et contact), ont ete emises par le Haut Conseil de sante publique. Ces recommandations se basent sur des criteres cliniques et temporels et recommandent une duree totale d’isolement d’au moins 14 jours apres le debut des symptomes en population generale et d’au moins 24 jours chez les patients immunodeprimes. D’autres recommandations internationales (notamment celles de l’eCDC et des Chinoises) associent aux criteres de levee d’isolement, une a deux PCR de controle sur ecouvillons nasopharynges. Notre etablissement centralise depuis le debut de l’epidemie les prelevements pour recherche de SARS-CoV-2 par RT-PCR sur ecouvillons nasopharynges pour 7 etablissements de sante. L’objectif de notre etude a ete d’evaluer la proportion de patients gardant une PCR positive a SARS-CoV-2 au-dela de 24 jours apres la premiere PCR positive. Materiels et methodes Etude retrospective incluant l’ensemble des patients ayant eu un depistage par PCR nasopharyngee (3 mars–10 juin 2020) au sein des 7 etablissements. Les donnees analysees ont inclus l’âge des patients, le delai de realisation (en jours) entre 2 PCR, le service clinique. Resultats A la date du 10 juin, 3603 depistages (dont 37 non-rendus pour problemes techniques) ont ete realises chez 3032 patients ; parmi ces patients, 348 ont eu plusieurs depistages : 278 ont ete depistes deux fois, 47 trois fois, et 23 quatre fois ou plus. La repartition des patients gardant une PCR positive au moins 24 jours apres la premiere etait la suivante : – 20 patients ont eu un depistage de controle entre 24 et 29 jours apres le premier depistage : 1 patient etait encore positif a j27 (5 %) ; – 42 patients ont eu un depistage de controle entre 30 et 41 jours : 8 etaient encore positifs (19 %) ; – 34 patients ont eu un depistage de controle apres 42 jours : 3 etaient encore positifs (9 %). Les 12 patients gardant une PCR positive au moins 24 jours apres la premiere, avaient ete hospitalises, avaient une moyenne d’âge de 66 ans et 7 d’entre eux avaient un cancer sous-jacent ou avaient necessite une prise en charge en reanimation. Conclusion Plus de 10 % des patients depistes au moins 24 jours apres le diagnostic microbiologique gardait une PCR nasopharyngee positive. Meme si l’excretion d’ARN viral n’equivaut pas directement a l’infectiosite, au vu des inconnues encore importantes sur le SARS-CoV-2, la levee precoce de l’isolement doit etre reflechie au cas par cas, en particulier pour les formes graves et les patients immunodeprimes.