甜菜 M14品系 BvM14-APX、 BvM14-DHAR3、BvM14-MDAR 基因响应 NaCl 胁迫的表达分析
2016
甜菜M14品系是在二倍体栽培甜菜染色体组上附加野生白花甜菜第9号染色体的单体附加系,具有耐盐性、无融合生殖等优良性状,是发掘优质基因资源的良好研究材料。实验室前期已利用iTRAQ串联LC-MS/MS技术获得0、200、400 mM NaCl胁迫下叶中差异表达蛋白质76个;与利用Hiseq 2000高通量测序技术构建的NaCl (0、200、400 mM )胁迫下甜菜M14品系转录组数据库相匹配,得到了3条参与抗氧化酶系统的BvM14-APX、 BvM14-DHAR3及 BvM14-MDAR的Unigenes序列。对3条Unigenes序列进行生物信息学分析;采用实时荧光定量PCR技术对0、200、400 mM NaCl胁迫下叶和根中的3条基因进行组织特异性分析,探究3条基因在叶和根中的表达趋势,并比较了叶中3条基因在转录水平和蛋白水平的表达量变化是否一致,借以评估3条基因对NaCl 胁迫的响应。实时荧光定量PCR结果表明, BvM14-APX 基因在200 mM NaCl胁迫下叶和根中分别上调21.56、3.56倍;400 mM NaCl胁迫下叶和根中分别上调51.27、11.47倍。 BvM14-DHAR3基因在200 mM NaCl 胁迫下叶和根中分别上调14.52、1.83倍;400 mM NaCl胁迫下叶和根中分别上调22.78、5.1倍。 BvM14-MDAR基因在200 mM NaCl胁迫下叶和根中分别上调29.04、1.33倍;400 mM NaCl胁迫下叶和根中分别上调59.3、3.81倍。3条基因在响应NaCl胁迫过程中,叶中的表达量变化均显著于根,同时叶中转录水平与蛋白表达水平的变化具有一致性,说明这3条基因在抗氧化酶系统中起到了重要的作用,这也为进一步探究BvM14-APX、 BvM14-DHAR3及BvM14-MDAR基因间互作关系奠定了基础。
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