VALIDAÇÃO DE RETROTRANSPOSONS ATIVOS EM CAFÉ- EFEITOS DE ESTRESSE ABIÓTICO E BAIXA CAFEÍNA NA EXPRESSÃO GÊNICA
2019
A identificacao de perfis de expressao genica diferenciais e redes metabolicas e uma ferramenta valiosa para a caracterizacao genetica de caracteres agronomicos. Neste estudo, utilizamos analises de expressao em larga-escala para identificar processos biologicos alterados em plantas com teores reduzidos de cafeina. A expressao diferencial de genes selecionados observada in silico foi entao validada em experimentos in viv o. O primeiro passo foi o sequenciamento em larga-escala de RNA extraido de tecidos jovens e em desenvolvimento, de plantas sem cafeina e de plantas com concentracoes normais do composto. As sequencias obtidas foram agrupadas, a partir de analises in silico , para identificacao de genes com expressao diferencial entre os tratamentos e de redes metabolicas associadas aos teores de cafeina. Para a validacao das analises in silico , selecionamos 3 genes de familias de retrotransposons para analises de qRT-PCR em gemas e folhas coletadas de plantas normais (MN) e sem cafeina (AC), tanto em condicoes normais quanto durante deficit hidrico. O perfil de expressao dos genes estabelecido por qRT-PCR foi distinto do observado nas analises de RNAseq. Alem disso, os resultados sugerem que plantas AC possuem uma maior suscetibilidade ao estresse hidrico, uma vez que a expressao de retrotransposons e mais alta em folhas e gemas de plantas AC do que em MN.
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