Nucelotide sequence of an ECHO virus isolated from a meningitis patient

目的测定山东省招远县1987年2～8月发生的无菌性脑膜炎大流行的病因病毒之W株病毒(Zhaoyuan/W/87)的部分序列,分析其与其他肠道病毒的关系.方法病毒用酚-氯仿抽提RNA,经逆转录合成cDNA,经聚合酶链反应(PCR)扩增,产物纯化,采用双脱氧链末端终止法在ABI377自动核酸测序仪上测定序列.结果 W株5′端非编码区、2C区和3D区的部分序列长度分别为244、275和353个核苷酸;VP1区全基因为876个核苷酸,编码292个氨基酸,与检索到的2株ECHO29核苷酸序列的同源性分别为82.1%和81.7%,氨基酸序列的同源性分别为95.1%和94.4%;与检索到的1株ECHO2核苷酸序列的同源性为62.3%.种系发生树分析,W株在单独的一个分支上,与2株ECHO29所在分支较近,与ECHO2所在分支较远.结论目前无法判定W株与ECHO2的关系,但可以说W株是ECHO29的变异味.