Uso de genomas de SARS-CoV-2 para la estimación del número reproductivo efectivo (Rt) en Perú durante marzo y abril del 2020

La comprension de la enfermedad por coronavirus (COVID-19) provocada por el coronavirus de tipo 2 (SARS-CoV-2) causante de sindrome respiratorio agudo severo, utilizando un enfoque multidisciplinario, es esencial para mejorar la toma de decisiones basadas en evidencia. Se estimo el numero reproductivo efectivo (Rt) en Peru a partir de 113 genomas completos generados por el Instituto Nacional de Salud (INS) del Peru almacenados en la base de datos publica GISAID. La tendencia mostrada por el Rt durante marzo y abril del 2020 fue similar a otras estimaciones epidemiologicas. El Rt disminuyo considerablemente durante la primera quincena de marzo, alcanzando su menor valor la semana posterior al inicio de la cuarentena, pero aumento moderadamente desde la quincena de abril. Se discute las implicancias de las medidas tempranas tomadas para mitigar la transmision. La vigilancia genomica sera una herramienta necesaria para conocer la transmision y evolucion del virus, complementando la informacion epidemiologica.