Predominance of a single genotype of Mycobacterium tuberculosis in regions of Southern Africa.

CONTEXTE: Zimbabwe et Zambie. OBJECTIF: Determiner la diversite genetique des souches de Mycobacterium tuberculosis isolees chez les patients tuberculeux au Zimbabwe et en Zambie. SCHEMA : Les isolats de M. tuberculosis cultives a partir de patients consultant dans les hopitaux de reference du Zimbabwe et dans les dispensaires de soins de sante de Zambie ont ete caracterises par un genotypage IS6110 et/ou par spoligotypage en utilisant des methodes standardisees internationales. Les donnees genotypiques ont ete comparees avec celles de Cape Town et de la base de donnees SpolDB3.0. RESULTATS: Un groupe predominant de souches a pu etre identifie chez 116 des 246 (47,2%) isolats du Zimbabwe par leur type de caracteristiques de bande IS6110 et une signature spoligotypique avec deletion des espaceurs 21-24, 27-30 et 33-36. La comparaison de ces souches avec celles provenant de Cape Town a montre qu'elles etaient etroitement en relation avec une famille de souches presente chez 2,3% des patients de Cape Town. La comparaison des spoligotypes avec ceux obtenus a partir des 114 isolats de Zambie a montre que 74 (65%) de ces isolats avaient la meme signature spoligotypique. Les spoligotypes dans la base de donnees SpolBB3.0 ont montre que ce groupe de souches n'etait que rarement isole dans d'autres parties du monde, mais frequemment en Afrique du Sud. CONCLUSION: Un groupe predominant de souches infectant pres de la moitie des patients de l'etude est un element contributif majeur de l'epidemie de TB dans cette region. Nous avons denomme ce groupe de souches la famille Southern Africa 1 (SAF1).