中国西藏小反刍兽疫病毒China／Tib／Gei／07—30磷蛋白基因的分子特征及其编码蛋白特性分析

对我国西藏小反刍兽疫病毒野生株China／Tib／Gej／07—30进行磷蛋白基因序列测定，并进行分子生物学特征分析。首先应用逆转录聚合酶链式反应扩增出病毒磷蛋白基因片段，对聚合酶链式反应产物进行直接测序，然后对测定的核苷酸和推测的氨基酸序列进行比较分析。小反刍兽疫病毒China／Tib／Gej／07—30磷蛋白基因由1655个核苷酸组成，编码2个相互交叠的开放阅读框（0RF）。第一个ORF长度为1530个核苷酸，编码的P蛋白长度为509个氨基酸。第二个ORF长度为534个核苷酸，编码的C蛋白长度为177个氨基酸。第一个ORF通过基因编辑在751位插入1个G核苷酸，转录生成第二个mRNA，长度为897个核苷酸，编码的V蛋白长度为298个氨基酸。小反刍兽疫病毒China／Tib／Gej／07—30的P蛋白与其他分离株氨基酸序列同源性为86．1％～97．3％，C蛋白氨基酸序列相似性为84．3％～94．9％，V蛋白为82．9％～96．3％。China／T．b／Gej／07—30的P蛋白第315～387位氨基酸是一段高度保守的七肽重复序列。