Déterminisme génétique de la dynamique de croissance et de la composition isotopique du carbone chez l'Eucalyptus en réponse aux variations environnementales

2014 
Les differents scenarios sur l'evolution du climat prevoient une augmentation de la frequence et de l'intensite des secheresses. La croissance des arbres forestiers etant fortement conditionnee par la disponibilite en eau, ces changements devraient impacter de maniere significative la productivite des forets plantees. La comprehension de l'impact des facteurs genetiques et environnementaux sur la dynamique de croissance est donc un enjeu majeur pour assurer les niveaux de production des plantations de demain. L'Eucalyptus, grâce a sa croissance rapide et a la disponibilite de ressources genetiques et genomiques, est un modele biologique ideal pour mener ces recherches. L'objectif de cette these est de caracteriser l'architecture genetique de la dynamique de croissance a differentes echelles de temps chez l'eucalyptus en relation avec : (i) les variations environnementales, et notamment l'evolution de la disponibilite en eau, et (ii) la composition isotopique du carbone de l'arbre (?13C), un caractere lie a l'efficience d'utilisation de l'eau. Pour repondre a cet objectif, un croisement interspecifique Eucalyptus urophylla x E. grandis a ete etudie dans quatre dispositifs experimentaux en Republique du Congo. Notre approche se base sur la cartographie des loci a effet quantitatif (QTL) et combine : (i) un genotypage haut debit, (ii) une caracterisation inter et intra-annuelle de la croissance et du ?13C, ainsi qu'un suivi en continu des micro-variations du rayon et (iii) une caracterisation en continu des facteurs environnementaux. Ces travaux ont tout d'abord conduit a la construction des premieres cartes genetiques a haute resolution chez l'Eucalyptus. L'analyse de l'architecture genetique du ?13C a ensuite permis de mettre en evidence des genes candidats positionnels, potentiellement impliques dans la variation de ce caractere. Enfin, la caracterisation inter et intra-annuelle de la dynamique de croissance a permis de montrer que l'architecture genetique de la croissance, au stade adulte, est structuree par les reponses a l'environnement au stade juvenile. Ces reponses ont ensuite ete analysees grâce aux profils de micro-variations du rayon, permettant ainsi de preciser leurs determinants genetiques Nos resultats soulignent l'importance de considerer la croissance comme un caractere dynamique, non seulement pour la comprehension de ses bases genetiques, mais egalement a des fins de selection de varietes adaptees a un environnement changeant. (Resume d'auteur)
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