Cloning and sequence analysis of a putative cell division protein gene ftsK of Streptococcus sobrinus

目的 克隆并分析远源链球菌(S.sobrinus)可能与细胞分裂相关的新基因ftsK. 方法采用"genome walking system(基因组步移系统)"克隆远源链球菌可能与细胞分裂相关的新基因ftsK,与GenBank进行同源性分析,并用蛋白质分析软件分析ftsK的氨基酸序列. 结果所克隆的新基因由2100个碱基组成,编码699个氨基酸.用GOR4软件对S.sobrinus ftsK的二级结构预测,显示其主要由α螺旋和无规卷曲组成,另有小部分伸展线,但无β折叠,在其N末端有一跨膜区.对氨基酸序列进行保守区分析,氨基酸335～530序列具有ftsK/SpoⅢE保守序列,同源性分析,除N末端226个氨基酸外,其余氨基酸序列与大肠杆菌细胞分裂蛋白FtsK的C末端2/3序列同源,217～635氨基酸与枯草杆菌SpoⅢE的C末端同源. 结论通过"基因组步移系统"克隆出的新基因可能与远源链球菌细胞分裂蛋白FtsK相关。