Polymorphismes protéique et génomique au sein des Morchellaceae : mise au point d'un outil moléculaire adapté à l'étude de l'écologie du genre Morchella en milieu forestier

1997 
Les morilles presentent une grande diversite de formes, difficiles a interpreter meme pour les specialistes. Ceci a engendre un grand nombre de classifications differentes. Par ailleurs, ces champignons presentent une grande variabilite de modes de vie, qui semblent fortement influences par des facteurs micro-ecologiques. Nous avons developpe un outil moleculaire base sur le polymorphisme de l'ADN ribosomal qui permet a la fois de clarifier la systematique ambigue des morchellacees et une approche plus precise de leur ecologie. Une etude prealable du polymorphisme isoenzymatique a montre que celui ci permet la separation precise des souches y compris au sein d'une espece, sans toutefois rendre compte des relations phylogenetiques. L'analyse par PCR/RFLP de l'espaceur interne transcrit de l'ADN, a permis la distinction de trois groupes d'especes avec des longueurs de l'ITS qui varient entre 740 et 1230 pb ; le sequencage de cette region a autorise une analyse de la phylogenie des morchellacees. Les distances phylogenetiques observees entre les groupes d'especes au sein du genre morchella sont comparables voire superieures a celles avec les genres voisins. Ceci suggere que de meme que les fausses morilles Mitrophora et Verpa ont ete exclues du genre Morchella au siecle dernier il paraitrait justifie de scinder les vraies morilles en deux voire trois genre. L'analyse de la region ITS permet egalement de mettre en cause la valeur de certaines especes de morille telle que M. Vulgaris. L'etude sur le terrain des associations avec des plantes a confirme la double aptitude des morilles a la symbiose et au parasitisme. L'etude en conditions controlees a apporte une confirmation experimentale de la specificite de M. Elata pour Pinus banksiana, qui avait ete decrite sur le terrain. La possibilite d'une association M. Esculenta-Betula pendula a en outre ete demontree. L'etude experimentale a egalement renforce l'hypothese du caractere crucial de l'association des morilles a des plantes superieures lorsqu'elles se developpent dans un contexte ecologique difficile.
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