Mise en évidence d'une population génétiquement différenciée de Venturia inaequalis, agent de la tavelure du Pommier, associée au contournement du gène majeur de résistance Vf

2004 
Les strategies de lutte genetique contre le champignon phytopathogene Venturia inaequalis reposent principalement sur l'utilisation de genes majeurs de resistance conferant une resistance totale contre la maladie. A la fin des annees 80, des souches du pathogene se sont averees virulentes en Europe vis-a-vis du dernier gene de resistance introgresse, le gene Vf, mettant en cause sa durabilite. Les travaux de cette these visent a comprendre la dynamique evolutive des populations de pathogenes face aux pressions de selections exercees par un gene majeur de resistance. A l'aide de marqueurs moleculaires de type microsatellites et AFLP, nous avons realise un suivi multi sites et pluriannuel de la structure genetique de populations de V. Inaequalis. Les resultats obtenus mettent en evidence une tres forte diminution de la diversite genetique des souches virulentes (virVf) sur les hotes Vf revelant une structure genetique de type effet fondateur. Nous montrons que les populations virVf, fortement differenciees des populations avrVf, seraient issues d'une meme source de virulence et se disperseraient de maniere aleatoire en Europe. Enfin, nous mettons en evidence un maintien de la differenciation genetique dans l'espace et dans le temps entre les deux populations. L'absence de flux de genes entre compartiments virVf et avrVf, revele un isolement reproducteur des souches virVf, en partie explique par le spectre d'avirulence de ces souches envers certains hotes non-Vf des vergers etudies. Les resultats obtenus au cours de ce travail, nous permettent de discuter sur l'origine et la dispersion de la virulence Vf puis de proposer des pistes de reflexion visant a preserver l'efficacite du gene de resistance Vf.
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