广东地区口蹄疫病毒 VP1 和 3A 基因的序列分析

目的 了解广东地区口蹄疫病毒(FMDV)的遗传变异情况，为我国FMDV流行病学的研究及防控提供基础数据。 方法 对2015—2016年间收集的广东地区猪的病料进行FMDV VP1 和 3A 基因的扩增测序和序列分析。 结果 11株O型FMDV均属耿马谱系毒株，7株A型FMDV均属Asia型毒株。11株O型FMDV的 VP1 基因与流行毒株相比，GD-MM-3株与O/BY/CHA/2010株序列相似性最高，为95.3%；GD-1株、GD-MM-1株和GD-MM-3株与O/MYA/1/98株序列相似性最高，为90.8%。7株A型FMDV的 VP1 基因与流行毒株相比，A/GDMM/CHA/2013株与GD-3株序列相似性最高，为99.8%；A/HuBWH/CHA/2009株与GD-3株序列相似性最高，为91.4%。11株O型FMDV的3A蛋白不存在氨基酸的缺失，7株A型FMDV的3A蛋白存在较多氨基酸的缺失。 结论 广东部分地区FMDV基因型复杂，预防控制困难。