基于线粒体 CO I序列的中国前鳞 遗传多样性分析

2019 
前鳞 ( Liza affinis )是分布于西北太平洋的日本南部及中国台湾海域等的经济鱼类。为了解中国前鳞 的遗传背景,该研究分析了采自中国4省82尾样本 CO Ⅰ基因5'端712 bp序列,共发现21个单倍型,遗传多样性( H d =0.4840±0.0700, π =0.0010±0.0002)较低。根据群体所属的地区、海域、海峡进行分组,通过AMOVA分析,得出组间的 F st 值皆小于0.05, P 值皆大于0.05,组间变异的比例极低(–0.6%~0.46%),表明中国前鳞 群体间无明显分化,其原因可能是:1)频繁的基因交流。前鳞 的洄游范围较大,且受海流影响,导致不同地区的群体间有着密切的基因交流;2)近期种群扩张事件。中国前鳞 整体的Fu’s Fs 值为显著性负值( F S = –20.3900, P =0),核苷酸错配峰图为明显单峰,单倍型网络图呈星状结构,均表明中国前鳞 群体经历过种群扩张,估算扩张大约发生在13.4199~1.4911万年前,可能是冰期和间冰期的交替中海平面的变化所致。此外,洞头群体的遗传多样性( H d =0.8080±0.1130, π =0.0021±0.0006)明显高于其他地理群体,建议将其作为优先保护的对象。
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