Population viability analysis on a native Danish cattle breed

2016 
espanolMuchas razas domesticas se enfrentan a desafios relacionados con la variabilidad genetica, debido a su pequeno tamano de poblacion que se acompana de un elevado riesgo de endogamia. Por ello, resulta importante conocer su riesgo de extincion, asi como las posibles ventajas de ciertas estrategias de seleccion. Puesto que muchas razas domesticas comparten los mismos problemas, los resultados de dichos estudios pueden ser aplicados independientemente de la raza o la especie. En este caso, se llevo a cabo un Analisis de Viabilidad de Poblaciones (AVP) para simular, basandose en el programa Vortex, la probabilidad futura de extincion de una poblacion de ganado bovino amenazado: el ganado danes de Jutlandia (Bos taurus). Un AVP evalua el riesgo de extincion de una poblacion teniendo en cuenta las amenazas y los datos demograficos. De acuerdo con los resultados del AVP, la poblacion se extinguira al cabo de 122 anos con el manejo actual. Se plantearon cuatro escenarios para investigar que cambios en el esquema de seleccion tendrian el mayor efecto sobre las probabilidades de supervivencia, incluyendo el escenario 1: Mas hembras en el nucleo reproductor, el escenario 2: Mas machos en el nucleo reproductor, el escenario 3: Una mayor capacidad de carga y el escenario 4: Aportar machos a la poblacion mediante inseminacion artificial con semen de toros empleados en las poblaciones en generaciones pasadas. Todos los escenarios presentaron un efecto positivo sobre la probabilidad de supervivencia de la poblacion y, con una combinacion de los diferentes escenarios, el tamano de la poblacion parece estabilizarse. Palabras clave: Analisis de Viabilidad de Poblaciones, Vortex, manejo genetico, programa de simulacion para la mejora genetica, Bos taurus EnglishMany domestic breeds face challenges concerning genetic variability, because of their small population sizes along with a high risk of inbreeding. Therefore, it is important to obtain knowledge on their extinction risk, along with the possible benefits of certain breeding strategies. Since many domestic breeds face the same problems, results from such studies can be applied across breeds and species. Here a Population Viability Analysis (PVA) was implemented to simulate the future probability of extinction for a population of the endangered Danish Jutland cattle (Bos taurus), based on the software Vortex. A PVA evaluates the extinction risk of a population by including threats and demographic values. According to the results from the PVA the population will go extinct after 122 years with the current management. Four scenarios were created to investigate which changes in the breeding scheme would have the largest effect on the survival probabilities, including Scenario 1: More females in the breeding pool, scenario 2: More males in the breeding pool, scenario 3: Increased carrying capacity, and scenario 4: Supplementing males to the population through artificial insemination using semen from bulls used in the populations in past generations. All scenarios showed a positive effect on the population’s probability of survival, and with a combination of the different scenarios, the population size seems to be stabilized. Keywords: Bos taurus, breeding simulation, genetic management, Population Viability Analysis, Vortex francaisDe nombreuses races domestiques font face a des defis lies a la variabilite genetique en raison de leur petite taille de population qui s’accompagne d’un risque eleve de consanguinite. Par consequent, il s’avere important de connaitre leur risque d’extinction, ainsi que les avantages potentiels de certaines strategies de selection. Vu que beaucoup de races domestiques confrontent les memes problemes, les resultats de ces etudes peuvent etre appliques sans distinction de race ou d’espece. Ici une Analyse de Viabilite des Populations (AVP) a ete menee pour simuler, en utilisant le logiciel Vortex, la probabilite future d’extinction d’une population de bovins menaces: les bovins danois du Jutland (Bos taurus). Une AVP evalue le risque d’extinction d’une population en tenant compte des menaces et des donnees demographiques. D’apres les resultats de l’AVP, la population s’eteindra apres 122 ans avec la gestion actuelle. Quatre scenarios ont ete presentes pour examiner quels changements dans le schema de selection auraient le plus grand effet sur les probabilites de survie, y compris le scenario 1: Plus de femelles dans le pool de reproducteurs, le scenario 2: Plus de mâles dans le pool de reproducteurs, le scenario 3: Une plus grande capacite porteuse et le scenario 4: Fournir des mâles a la population par le biais de l’insemination artificielle avec du sperme de taureaux utilises dans les populations dans les generations passees. Tous les scenarios ont presente un effet positif sur la probabilite de survie de la population et, avec une combinaison des differents scenarios, la taille de la population semble se stabiliser. Mots-cles: Analyse de Viabilite des Populations, Vortex, gestion genetique, logiciel de simulation pour la selection, Bos taurus
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