First molecular epidemiological study of tuberculosis in Benin.

OBJECTIF : Evaluer la diversite genetique des souches de Mycobacterium tuberculosis a Cotonou, Benin, et les facteurs de risque associes au regroupement des souches en grappes. METHODES : Nous avons analyse les echantillons d'expectoration provenant de 194 nouveaux cas de tuberculose pulmonaire a microscopie positive admis de facon consecutive. Un echantillon par patient a ete analyse au moyen de deux tests genotypiques : le spoligotypage et le « mycobacterial interspersed repetitive unit-variable number of tandem repeats » (MIRU-VNTR) utilisant 12 loci. Les profils des souches obtenus ont ensuite ete compares a ceux de la base de donnees internationale SpolDB4.0. RESULTATS: Nous avons observe que le spoligotype le plus frequent a Cotonou est le spoligotype 61 suivi du type « Beijing », qui represente 10,3% des souches et qui est, par ailleurs, associe a la resistance a la streptomycine. Nous avons par ailleurs confirme que la combinaison du spoligotypage et du MIRU-VNTR est plus discriminante que chacun des tests pris isolement. CONCLUSION: Le spoligotype 61 et le type « Beijing » sont les genotypes les plus frequents a Cotonou.