MMP-26的同源模建及S1’结合袋的结构特点

以基质金属蛋白酶-12（ MMP-12）的晶体结构为模板，采用同源模建方法构建了基质金属蛋白酶-26（MMP-26）的三维结构，并阐明了其S1＆#39;结合袋的结构特点， MMP-26中His233残基插入S1＆#39;结合袋，限制了S1＆#39;结合袋的深度，符合中袋MMPs的特点，因此MMP-26属于中袋MMPs.在此基础上，研究了抑制剂GM6001与MMP-26的相互作用模式，发现GM6001中异羟肟酸结构的羰基氧和羟基氧与催化锌离子发生双齿配位，符合异羟肟酸类MMPs抑制剂的配位特点.