Restauration et reconnaissance des formes dans des images avec bruit de Poisson : application à l'analyse des neurones en microscopies de fluorescence

Dans le cadre de l'etude du cerveau, les biologistes et les medecins s'interessent a de petites excroissances sur les dendrites appelees epines dendritiques. Ces epines jouent un role important au niveau des transmissions synaptiques. Elles sont observees par fluorescence avec un microscope confocal. Les images acquises sont difficiles a exploiter car elles sont 1) degradees par le flou du aux limites de la diffraction et du bruit, 2) les epines presentent une grande diversite morphologique et 3) une dendrite peut posseder une densite importante d'epines. Cette these se decompose donc en trois parties : la premiere partie presente un cadre theorique d'optimisation aboutissant a des algorithmes de deconvolution sous bruit de Poisson. La deuxieme partie concerne la comparaison de formes par leur morphologie avec des noyaux sur graphes. La troisieme partie propose une plateforme d'exploitation d'images d'epines pour obtenir automatiquement des informations morphologiques sur ces epines.