Virulence et spécificité d’hôte de leptospires pathogènes endémiques de Madagascar et ses îles voisines

La leptospirose est une zoonose d’importance medicale majeure dans les iles du Sud-Ouest de l’Ocean Indien (SOOI) dont certaines enregistrent des incidences parmi les plus elevees au monde. Durant la derniere decennie, les donnees epidemiologiques moleculaires obtenues avec une approche « One Health » ont mis en evidence une grande diversite de lignees de leptospires ainsi que differentes chaines de transmission sur les differentes iles de la region. Les donnees moleculaires montrent la presence de leptospires pathogenes et de reservoirs animaux introduits ou endemiques de cette region. La distribution de ces differentes lignees de leptospires est associee a (i) un contraste epidemiologique incluant des differences dans la severite des cas humains et (ii) des niveaux de specificite d’hotes differents selon les leptospires consideres. Plus particulierement, les leptospires endemiques du SOOI semblent etre moins pathogenes chez les humains et montrent une plus forte affinite pour leur reservoir que les leptospires cosmopolites. Pour completer nos connaissances sur l’histoire evolutive des leptospires du SOOI, nous avons produit des donnees provenant de chauves-souris de l’Afrique de l’Est. Ces donnees confirment la specificite de certaines lignees de leptospires envers leurs hotes chiropteres et suggerent que les chauves-souris d’Afrique ont colonise Madagascar tout en etant infectees par leurs leptospires. Afin de mieux comprendre le role des differents leptospires dans l’epidemiologie regionale de la leptospirose, nous avons mesure la pathogenicite de trois souches de leptospires retrouvees dans cette region a l’aide d’un modele hamster. Des souches de Leptospira mayottensis et Leptospira borgpetersenii ont ete isoles respectivement de Tenrec ecaudatus (tenrec) et Triaenops menamena (chauve-souris), deux mammiferes endemiques du SOOI. Une souche de Leptospira interrogans, dont le genotype est retrouve dans la majorite des cas humains graves a la Reunion, a ete isolee de Rattus rattus (rat). En coherence avec les donnees epidemiologiques humaines de Mayotte et de La Reunion, les leptospires endemiques se sont revelees etre significativement moins pathogenes que la souche L. interrogans. La specificite d’hote des deux souches isolees de mammiferes endemiques a ete mise a l’epreuve par des infections experimentales de Rattus norvegicus, connu comme un reservoir important de leptospires. Les rats ont ete infectes avec les trois isolats precedemment utilises. Les rats infectes par les souches endemiques n’ont pas developpe d’infection renale chronique contrairement a la souche cosmopolite. Ces resultats montrent que la specificite d’hote des leptospires endemiques observee in natura est probablement due a des facteurs genetiques plutot qu’a des facteurs ecologiques, comme un manque de contacts physiques entre les reservoirs animaux endemiques et introduits. Enfin, le sequencage complet de souches de leptospires du SOOI a ete realise afin d’identifier des caracteristiques genetiques pouvant etre associees a la pathogenicite et la specificite d’hote des leptospires pathogenes. Une classification precise de souches de leptospires du SOOI a pu etre realisee sur la base des genomes complets. La comparaison de ces genomes a permis d’identifier des genes specifiques a un groupe ou une espece de leptospires. Cependant des modifications genomiques complexes rendent difficiles l’identification de caracteristiques genomiques responsables d’un phenotype particulier tel que la virulence ou la specificite d’hote.