La microflore associée à la muqueuse intestinale chez l'homme dans le contexte de la maladie de Crohn

La maladie de Crohn (MC) est une maladie inflammatoire cryptogenetique de l'intestin caracterisee par une inflammation segmentaire du tube digestif et evoluant par poussees entrecoupees de phases de remission. Elle atteint generalement des sujets jeunes et son etiologie reste inconnue a ce jour. C'est une maladie multifactorielle dans laquelle interviennent probablement une predisposition genetique, associee a une reaction exageree du systeme immunitaire en reponse a un facteur environnemental. De nombreux arguments placent la microflore associee a la muqueuse comme facteur essentiel au developpement ou au maintien de la MC. Des strategies d'analyse de la biodiversite ont ete appliquees avec pour objectif la caracterisation de la microflore associee a la muqueuse chez des individus sains et des patients atteints de MC. Il est apparu que la microflore mucosale dominante constitue un ecosysteme original differant de la microflore fecale. Elle est de plus specifique de chaque individu et stable le long du tube digestif distal, de l'ileon jusqu'au rectum. Ces caracteristiques sont egalement retrouvees au cours de la MC. Il est de plus notable qu'au cours de la MC, la microflore mucosale dominante des patients reste tres similaire entre tissus non ulceres et ulceres. La strategie de l'inventaire moleculaire, appliquee a des biopsies de 2 patients en poussee de MC, a quant a elle permis de montrer que 2 OTUs proches de Faecalibacterium prausnitzii et de Ruminococcus torques etaient uniquement observees dans les tissus sains chez les 2 patients. La biodiversite des bacteries du groupe Clostridium leptum etait diminuee au niveau des tissus ulceres, mais aucune espece bacterienne particuliere n'a pu etre specifiquement attribuee a ces zones. Ces resultats viennent donc renforcer le concept de dysbiose au niveau mucosal, d'autant qu'aucune espece pathogene n'a ete mise en evidence. Cette dysbiose pourrait etre le resultat de l'installation post natale d'une flore "a risque". Elle pourrait egalement faire intervenir d'autres microorganismes, voire des virus procaryotes comme le suggerent nos travaux. Si un phenomene de dysbiose est demontre sur un nombre plus important de patients, des "modulations" de la microflore, notamment via l'utilisation de probiotiques, pourraient permettre de reequilibrer cette microflore.