مطالعه پویش کامل ژنوم با تجزیه و تحلیل غنیسازی مجموعههای ژنی جهت شناسایی ژنها و مسیرهای مرتبط با خلق و خوی در گاو براهمن

درک کنترل ژنتیکی خلق و خوی به عنوان یک صفت پیچیده و دارای همبستگی با صفات اقتصادی یکی از اهداف اصلاح نژادی در صنعت گاو گوشتی است. هدف پژوهش حاضر، مطالعه پویش کل ژنوم بر مبنای تجزیه و تحلیل غنی‌سازی مجموعه ژنی جهت شناسایی جایگاه‌های ژنی مؤثر بر صفات مرتبط با خلق و خوی گاو نژاد براهمن بود. بدین منظور از اطلاعات ژنوتیپی 1370 رأس گاو براهمن و رکوردهای فنوتیپی شامل سرعت خروج، امتیاز پن و امتیاز خلق و خوی استفاده گردید. ارزیابی پویش کامل ژنوم با PLINK نسخه 90/1 انجام شد. تجزیه و تحلیل غنی‌سازی مجموعه‌های ژنی بوسیله بسته نرم‌افزاری goseq برنامه R با هدف شناسایی مسیرهای زیستی ژن‌های نزدیک در مناطق انتخابی کاندیدا انجام شد. در نهایت تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی از پایگاه‌های برخط GO، Metacyc، KEGG، Reactome و Panther استفاده گردید. با تجزیه و تحلیل غنی‌سازی مجموعه‌های ژنی، مسیرهای بیوشیمیایی و )ژن‌های کاندیدای( neurotransmitter secretion (NRXN3 و CACNG3)،‌Cycle Dopamine Neurotransmitter Release (PPFIA2)، regulation of neuron projection development (GRID2)، neuron projection (SLC8A1 و KCNQ2)، Axonal growth inhibition (RTN4R)، Neurotrophin signaling pathway (MAP2K2، MAP3K5 و PSEN1) و Focal adhesion (TLN2) مرتبط با سرعت خروج شناسایی شدند. ژن‌های کاندیدا شناسایی شده نقش مهمی در تفرق و تمایز سیناپس‌ها، انتقال دهنده‌های عصبی، بیماری‌های عصبی و اختلال روانی، استرس‌های اکسیداتیو و محیطی، گیرنده‌های هورمونی و هموستازی گلوکز داشتند. با توجه به تأیید مناطق قبلی پویش ژنومی و شناسایی مناطق ژنومی جدید، استفاده از یافته‌های این پژوهش می‌تواند در انتخاب ژنتیکی حیوانات با تولید بالاتر از طریق دام‌های آرام مفید باشد.