短花药野生稻(Oryza brachyantha) AQP家族的全基因组序列鉴定及其特 征分析

2020 
摘 要 : 水通道蛋白 (aquaporin, AQP) 介导植物各组织间水分转运,参与植物体内物质跨膜转运,在植物各种生理过程中发挥着重要作用。短花药野生稻作为一种具有优良性状的野生稻,其 AQP 基因家族成员的特征还尚未了解透彻。为此,本研究鉴定了 39 个短花药野生稻的水通道蛋白基因 ( ObAQP ) ,根据进化树将其分类,并进行基因结构分析、蛋白质保守基序分析、基因启动子预测和染色体定位分析。结果表明:短花药野生稻中的 AQP 可以分为 PIPs 、 NIPs 、 TIPs 和 SIPs 四个亚族; ObAQP 蛋白质保守基序大多数都可能参与跨膜转运、通道活动以及膜相关功能;启动子分析表明 ObAQP 基因至少含有一个应激反应性顺式元件; ObAQP 基因在染色体上分布并不均匀。以上分析结果简要归纳了短花药野生稻 AQP 基因家族的特征,为以后深入研究 ObAQP 基因功能未来栽培稻性状改良提供了理论依据。
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