宽体沙鳅(Botia reevesae)β-肌动蛋白基因的cDNA克隆与表达分析

2013 
利用RT-PCR和快速扩增cDNA末端(rapidamplificationofcDNAends,RACE)技术首次克隆了宽体沙鳅(Botiareevesae)β-肌动蛋白基因的cDNA全序列,该序列全长为1795bp,由长100bp的5’非翻译区(untranslatedregion,UTR)、570bp的3’非翻译区和1125bp的开放阅读框(openreadingflame,ORF)组成。编码375个氨基酸。宽体沙鳅β-actin氨基酸序列包含1个糖基化位点、9个N-豆寇酰化位点、3个actin信号位点等主要结构区域。PSI-BLAST比对表明,宽体沙鳅β-actin氨基酸与真鲷、罗非鱼、虹鳟等鱼类同源性达99%。NJ法系统进化分析显示宽体沙鳅β-actin首先与鲢聚在一起,然后与鳃、尖头秽等鱼类聚在一起。荧光定量PCR检测β-actin基因在宽体沙鳅脑、鳃、心脏、肝、胃等12个组织的表达无显著差异(P〈0.05),具有良好的稳定性。
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