Molekulare Muster der bakteriellen Besiedlung von Möhren aus ökologischer und konventioneller Erzeugung

Um festzustellen, wie sich unterschiedliche Anbauformen auf die bakterielle Besiedlung von Mohren auswirken, wurde Erntegut aus definierter Erzeugung bis zu sieben Monate gelagert (5°C, 95% relative Feuchte) und die bakterielle Flora auf der Oberflache mit Hilfe DNA-basierter Fingerprint-Methoden charakterisiert. Wahrend der Lagerung verdarben vier von 34 Mohrenvarianten sichtbar durch Pilze, davon zwei Proben von Mohren aus okologischem Anbau, die experimentell im Rahmen eines Feldversuchs mit organischem Stickstoff „uberdungt“ worden waren. Die Fingerprint-Methoden SSCP (Single Strand Conformation Polymorphism) und ARDRA (Amplified Ribosomal DNA Restriction Analysis) weisen Unterschiede in der ribosomalen RNA nach und erfassten Unterschiede in der Zusammensetzung der Bakterienflora sowie deren Verschiebung wahrend der Lagerung von Mohren. Deutliche Effekte der Anbauform gab es nicht. Die T-RFLP(Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism)-Methode, eine Weiterentwicklung der ARDRA, erfasste Unterschiede in der Bakterienbesiedlung bei Mohrenproben mit sichtbarem Verderb.