Análisis filogenético del virus del chikungunya en Colombia: evidencia de selección purificadora en el gen E1

Introduccion. El virus del chikungunya, perteneciente al genero Alphavirus de la familia Togaviridae, es un virus ARN de 11,8 kb, de cadena sencilla y polaridad positiva, transmitido por Aedes spp. Se han identificado tres genotipos a nivel mundial: el de Asia, el del este-centro-sur de Africa ( East/Central/South African , ECSA) y el de Africa occidental ( West African , WA). La fiebre del chikungunya es una enfermedad febril aguda, acompanada principalmente de inflamacion en las articulaciones y erupcion cutanea. Despues de su aparicion en las Americas en el 2013, los primeros casos en Colombia ocurrieron en septiembre de 2014 y hasta junio del 2015 se habian notificado 399.932 casos. Objetivo. Identificar el genotipo o los genotipos responsables de la primera epidemia por el virus del chikungunya en Colombia y la variabilidad genetica asociada a su dispersion en el territorio nacional. Materiales y metodos. Se seleccionaron muestras de suero de pacientes con sintomas indicativos de fiebre del chikungunya durante 2014 y 2015. Se hizo una transcripcion inversa seguida de reaccion en cadena de la polimerasa del gen E1 , asi como su secuenciacion, analisis filogenetico y analisis de evolucion adaptativa. Resultados. Se demostro la presencia exclusiva del genotipo de Asia en Colombia. Se registro un promedio de 0,001 sustituciones de bases por sitio, una identidad de 99,7 a 99,9 % en los nucleotidos y de 99,9 % en los aminoacidos entre las secuencias colombianas y las secuencias de las Americas. Los analisis de evolucion adaptativa indicaron una fuerte seleccion purificadora en el gen E1 . Conclusiones. Se determino la circulacion del genotipo de Asia del virus del chikungunya como la causa de la primera epidemia en Colombia. Es necesario continuar con la vigilancia de genotipos, con el fin de detectar posibles cambios en la epidemiologia, la eficacia ( fitness ) viral y la patogenia del virus.