İnsan tükürüğünde post-translasyonel modifikasyona uğramış glikoproteinler ve fosfoproteinler ile birlikte modifikasyon bölgelerinin tanımlanması

Iki boyutlu jel elektroforezi proteomik laboratuvarinda hem analitik hem de preparatif acidan oldukca onemli klasik bir aractir. Bu teknik hastaliklarda ozellikle glikoprotein ve fosfoprotein gibi anlamli post-translasyonel modifikasyonlari tanimlayan proteom degisimlerini aciklamak icin kullanilabilir. Saglikli periodontitis ve agresif periodontitis bireylerinin tum tukuruk proteomlari deglikolizasyon icin triflorometansulfonik asit (TFMS) ile defosforilasyon icinse hidroflorik asit (HF) ile muamele edilmistir. Taze (ya da dondurulmus) tum tukuruk ornekleri cozunmeyen partikulleri uzaklastirmak amaciyla laboratuvarda santrifuj edilmistir. Toplam protein konsantrasyonu Bradford analizi ile belirlenmistir. Post translasyonel modifikasyonlari tanimlayabilmek icin TFMS ve HF ile muameleden once ve sonra kosturulan ve gumus boyama neticesinde elde edilen 2DE jel goruntulerindeki  spot patern fakliklarini belirlemek amaciyla karsilastirilmistir. Jellerde kimyasal muameleden once, 113 ± 27 spot tespit edilmistir. Fakat yazilim programi, kisitli olmasindan dolayi, muameleden sonra istatistiksel olarak anlamli verilerin bulunmasina izin vermemistir. Hastalikli ve saglikli bireylerde tespit edilen proteinler ise dusuk konsantrasyonlarindan dolayi MALDI-MS’de tanimlanamamistir.