ACINETOBACTER CALCOACETICUS- ACINETOBACTER BAUMANNII COMPLEX (ABC) VE YENİ TÜRLERİ

Acinetobacter cinsi’nin siniflandirilmasinda 12 farkli genomik tur bulundugu gosterilmis, taksonomisinde son 30 yilda DNA-temelli metotlarin yaygin kullanimi sayesinde degisiklikler kaydedilmistir. Bugun icin Acinetobacter cinsi icerisinde 49 tur bulunmaktadir. A. calcoaceticus- A.baumannii complex icinde (ABC) klinik olarak onemli turler olan A. baumannii (genomik tur 2), Acinetobacter nosocomialis (genomik tur 13TU), Acinetobacter pittii (genomik tur 3) ve Acinetobacter calcoaceticus (genomik tur 1) turleri biyokimyasal olarak ayird edilemezler. DNA-DNA hibridizasyon, rpoB gen sekans analizi ve multilocus sequence typing (MLST) ile A. calcoaceticus- A. baumannii complex’e son yillarda iki yeni patojenik tur olan Acinetobacter seifertii ve Acinetobacter djikshoorniae eklenmistir. Ayrica non-A.baumannii turleri arasinda plazmide lokalize blaNDM-1 geni tasiyan ve A. djikshoorniae’nin model susu olan JVAP01T susunun taslak genom dizilimi de yayinlanmistir. Bugun icin; Acinetobacter cinsinin tur duzeyinde ayrimi icin; RNA polimeraz β-subunit (rpoB) geni, DNA giraz B (gyrB) geni sekans analizi ve/veya multilocus sequence analysis (MLSA) altin standard molekuler metotlar olarak kabul edilmektedir. Diger yontemler; amplified ribosomal DNA restriction analysis (ARDRA), Fourier transform infrared spectroscopy (FTIR) , ve Matriks assisted lazer desorption ionization time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS)’dur. Acinetobacter turlerine karsi antimikrobiyal direnc gelisimini onlemek icin izolatlarin tur duzeyinde guvenilir yontemler kullanilarak tanimlanmalari, uygun antibiyotiklerin kullanilmasi ve kesintisiz enfeksiyon kontrol onlemlerinin uygulanmasi onemlidir.