In silico analysis of transferable QepA variants and related chromosomal efflux pump

Objetivos. El objetivo del presente estudio fue detectar la presencia en GenBank de variantes de QepA no descritas. Materiales y metodos. Las secuencias de ADN y aminoacidos de QepA1 se compararon en GenBank. Solo se consideraron las identidades >80%. Las secuencias sinteticas o parciales no se incluyeron en los analisis. Resultados. Los resultados mostraron la presencia de 10 variantes de QepA, 6 de ellas sin designacion alelica. Adicionalmente se observaron elevados niveles de identidad con bombas MSF cromosomales del genero Pseudorhodoferax y de otras Comamonadaceae. Conclusiones. Se reporta la presencia en GenBank de variantes no descritas de QepA, asi como la presencia en miembros del orden Burkholderiales de secuencias relacionadas.