Etude genotypique des mycobacteries atypiques

Les mycobacteries autres que les agents de la tuberculose et de la lepre representent une vaste famille d'especes qui jouent un role de plus en plus important en pathologie humaine. Il est generalement admis que les infections a mycobacteries atypiques sont acquises de l'environnement ou elles sont largement presentes. Dans la premiere partie de notre travail, nous avons developpe et evalue des techniques d'epidemiologie moleculaire pour l'etude des trois especes de mycobacteries atypiques les plus frequemment rencontrees au centre national de reference des mycobacteries : m. Xenopi, m. Avium et m. Kansasii. Un test pcr pour l'identification de m. Xenopi a ete developpe et est maintenant utilise en routine. L'etude des souches de m. Avium isolees de patients atteints du sida inclus dans l'essai therapeutique curavium anrs033 a permis de degager ce qui releve de variations epidemiologiques geographiques et de determiner les caracteristiques bacteriologiques de l'infection disseminee a m. Avium. Enfin, nous avons mis en evidence l'existence de cinq sous-especes de m. Kansasii d'importance clinique differente et confirme le role preponderant de l'eau potable comme source d'acquisition d'infections mycobacteriennes. Dans une deuxieme partie, nous decrivons l'identification des premiers plasmides lineaires mycobacteriens chez m. Xenopi, m. Celatum, m. Branderi et m. Avium. Ces plasmides ont une structure de type invertron, proche des replicons lineaires decrits chez les streptomyces. D'autre part, nous avons isole et sequence 5 nouvelles sequences d'insertion, appartenant a la famille is256, chez m. Xenopi, m. Celatum, m. Branderi et m. Gordonae. Ces elements partagent les memes caracteristiques structurales et, pour certains, une meme origine phylogenetique. L'identification de ces elements mobiles et extra-chromosomiques ouvrent de nombreuses perspectives pour le developpement de marqueurs epidemiologiques et d'outils genetiques.