Sélection génomique multivariée chez le palmier à huile

La selection genomique (Meuwissen et al., 2001) s'impose aujourd'hui comme une methode performante en amelioration des animaux d'elevage et des cultures. Le present memoire traite de l'utilisation de marqueurs SSR dans un programme de selection recurrente reciproque du palmier a huile (Elaeis guineensis Jacq.), avec des donnees empiriques. Nous comparons differents modes de calculs de l'apparentement moleculaire a partir des donnees SSR afin d'optimiser le modele G-BLUP. Nous montrons que le modele G-BLUP base sur la matrice d'apparentement d'Eding et Meuwissen (2001) est plus performant que le modele BLUP base sur le pedigree, ou que le modele G-BLUP base sur une matrice d'apparentement de VanRaden (2007). Grâce a la variance d'erreur de prediction (VEP), nous observons que le G-BLUP multivarie apporte une meilleure precision de selection que le G-BLUP univarie pour predire l'aptitude generale a la combinaison (AGC) des geniteurs lors d'un test genetique. Cependant la correlation tres forte entre les AGC predites par les modeles univaries et multivaries est contradictoire avec l'amelioration elevee estimee par la formule de la VEP. Enfin, nous determinons le nombre de marqueurs SSR minimal pour assurer les performances du modele G-BLUP, mais aussi du modele BayesB univarie. Nous observons que le modele BayesB univarie fonctionne mieux a faible densite de marqueurs SSR que le modele G-BLUP. Nous constatons egalement que la densite de marqueurs minimale a partir de laquelle les modeles genomiques surpassent le modele base sur le pedigree depend de la population (130 SSR pour le groupe A et 60 SSR pour le groupe B). (Resume d'auteur)