Altérocine : une protéine antibiofilm secrétée par la bactérie marine Pseudoalteromonas sp. 3J6

Le biofilm est un mode de vie qui confere aux bacteries une protection contre les agents antimicrobiens et pose un probleme de sante publique qui necessite de trouver une alternative aux traitements actuels. La bacterie marine Pseudoalteromonas sp. 3J6 et ses exoproduits (SN3J6) montrent une activite antibiofilm contre des bacteries marines et terrestres. Une proteine, nommee alterocine, a ete extraite du SN3J6. Bien que presente chez plusieurs autres souches de Pseudoalteromonas, son role est encore inconnu dans les bases de donnees. Ce projet a ete consacre a l’etude de l’alterocine. Les caracteristiques de cette proteine ainsi que celles de son gene, alt, ont dans un premier temps ete etudiees. Le gene alt n’est pas organise en operon et plusieurs promoteurs potentiels ont ete identifies. Il est exprime preferentiellement durant la phase stationnaire. Il code une proteine de 139 residus incluant un peptide signal predit, qui permettrait la secretion de l’alterocine mature (119 residus). Aucune homologie de sequence n’a ete observee entre l’alterocine et les proteines de fonction connue des bases de donnees. Afin de detecter plus facilement l’alterocine dans le surnageant de culture, des anticorps anti-alterocine ont ete obtenus. Nous avons dans un second temps confirme l’activite antibiofilm de l’alterocine par une production heterologue chez une autre souche de Pseudoalteromonas et en comparant les biofilms obtenus en presence des surnageants de culture de cette souche et de sa souche mere. Nous avons montre que l’alterocine est un nouveau type de proteine antibiofilm dont la structure et le mode d’action restent a determiner pour l’utiliser comme agent antibiofilm.