Analyse d'adresses fixes de séquences étiquetées

L'invention concerne une methode pour l'analyse approfondie d'echantillons d'acide nucleique et une composition de detection destinee a etre utilisee dans cette methode. Cette derniere, designee sous le nom d'analyse d'adresses fixes de sequences etiquetees (en anglais, FAAST), consiste a generer un jeu de fragments d'acide nucleique presentant une variete de sequences terminales collantes; a indexer ces fragments sous forme de jeux, sur la base de la sequence d'extremites collantes; a associer la sequence de detection avec les fragments; a pieger les sequences des fragments indexes sur un reseau de detection; et a detecter les etiquettes de fragments. Pour generer ces multiples sequences terminales collantes, on incube l'echantillon d'acide nucleique avec un ou plusieurs reactifs de clivage d'acide nucleique. Les fragments indexes sont pieges par hybridation et par couplage a une sonde, de preference par ligature. Cette methode permet de cataloguer rapidement et facilement un echantillon complexe d'acide nucleique, d'une maniere reproductible et specifique d'une sequence. Un mode de realisation de cette methode permet de determiner les associations, dans une molecule d'acide nucleique, des differentes combinaisons de sequences connues ou potentielles. Un autre mode de realisation de cette methode evalue la modification des sequences dans les molecules d'acide nucleique en basant le clivage des molecules sur la presence ou l'absence de modification.