RAPD Analysis for Micropterus salmoides and Tilapia nilotica

2010 
利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对加洲鲈和罗非鱼种群间的亲缘关系进行分析。品种间带纹相似系数(共享度)根据Lynch的公式进行计算:F_(xy)=2N_(xy)/N_x+N_y(N_(xy)是RAPD指纹图谱中品种X和品种Y的共有带纹数,N_x和N_y分别为品种X和品种Y各自可分辨带纹总数)。品种间的遗传距离(D)根据2个品种的共享度(F)来计算:D=1-F。根据遗传距离的D值,再用UPGMA法求出各类间距离后再聚类。结果显示:从20个随机引物中筛选出4个清晰,多态性丰富的引物用于分析。各种群平均每一引物所获得的带纹数为:加洲鲈7.8±2.45,罗非鱼5.1±1.87。4个引物共扩增出加洲鲈35条带其中特异性带16条,罗非鱼21条带其中特异性带8条,测得加洲鲈与罗非鱼之间的带纹相似系数为0.236,遗传距离为0.764,表明加洲鲈和罗非鱼之间的亲缘关系较远。
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