番茄 JMJ524 基因调控 SlGLD1 的DNA甲基化分析

旨在分析番茄 JMJ524 基因如何通过影响 SlGLD1 的DNA甲基化程度来调控其表达，从而导致番茄的赤霉素不敏感的矮化。利用生物信息学和BSP（Bisulfite sequencing PCR）分析 JMJ524 抑制系和野生型的 SlGLD1 的DNA甲基化程度。结果显示，分离出 SlGLD1 的启动子序列，发现其启动子区域含有3个GA响应的顺式作用元件； SlGLD1 的启动子区域和编码区的DNA是高度甲基化的，而且在不同组织部位和突变体中的甲基化模式是不一样的；在基因的编码区发现了两个GC岛，推测 SlGLD1 的甲基化可能发生在基因的编码区；针对这两个GC岛进行的BSP分析结果表明： SlGLD1 的这两个区段的DNA CpG是高度甲基化的，而且在 JMJ524 抑制系中，DNA的整体甲基化，特别是CpG甲基化程度显著低于野生型对照M82。 JMJ524 抑制表达导致了 SlGLD1 的基因甲基化程度降低，从而激活这个基因的表达，可能是导致番茄植株矮化的一个因素。