Utilisation du genexpert dans le diagnostic de la tuberculose extrapulmonaire (TEP) au CHNU de Fann de Dakar

Introduction La simplicite et la haute sensibilite de GeneXpert MTB/RIF en font un bon test de diagnostic pour la detection rapide de la tuberculose surtout pulmonaire et la resistance a la rifampicine. Methodes Nous avons mene une etude retrospective sur les resultats du GeneXpert realises sur les prelevements extrapulmonaires soumis au laboratoire de mycobacteriologie du service de pneumologie du CHNU de Fann de Dakar (Senegal) de 2012 a 2015. Les echantillons provenaient de patients soupconnes d’avoir une infection tuberculeuse sur la base de criteres cliniques ou pour ecarter cette infection. Resultats Durant cette periode, 2275 GeneXpert ont ete realises. La majeure partie des prelevements recus par le laboratoire etaient d’origine pulmonaire avec un total de 1658, contre 617 pour les prelevements extrapulmonaires. Le Genexpert etait positif dans 27,9 % ( n  = 463) des prelevements pulmonaires et dans 11,6 % ( n  = 72) des prelevements extrapulmonaires. Le test etait positif pour 29/102 liquides de ponction pleurale, pour 29/48 prelevements de pus, 8/110 LCR, 4/4 liquides de ponction ganglionnaires, 1/7 prelevements d’urines, 1/5 liquides de ponction pericardique et 0/33 liquides de ponction d’ascite. Une co-infection TB/VIH etait retrouvee chez 59 patients. Pour ces malades, le GeneXpert etait revenu positif 4 fois/12 dans le liquide pleural, 2 fois/36 dans le LCR, 2 fois/4 dans le pus et 1 fois dans le liquide pericardique. Il a ete realise et est revenu negatif dans 4 liquides d’ascite et 2 prelevements d’urines. Conclusion Le diagnostic de TEP est difficile en raison de la nature paucibacillaire des specimens, du manque de volumes d’echantillons cliniques adequates et de la distribution non uniforme des bacteries dans ces echantillons ainsi que la localisation de la maladie dans des sites difficiles d’acces. Le GeneXpert peut etre applique a des echantillons extrapulmonaires avec une grande sensibilite et specificite, qui, couplee a sa vitesse et sa simplicite, font de cette technique un outil tres utile pour le diagnostic de la TEP.