Sensibilité aux échinocandines des souches de C. glabrata isolées en réanimation chirurgicale au CHU de Tours (nov 2013–avril 2014) : étude phénotypique et génotypique

Introduction Candida glabrata est une espece de levures frequemment isolee lors des infections profondes affectant les patients de reanimation chirurgicale. Depuis leur commercialisation, les echinocandines sont apparues comme la premiere option therapeutique vis-a-vis des souches qui presentent des concentrations minimales inhibitrices (CMIs) elevees au fluconazole. Cependant, il a ete recemment rapporte que l’usage croissant de cette classe d’antifongiques pouvait conduire a l’apparition de mutations sur les sequences FKS1  et FKS2 , qui codent les sous-unites de la proteine-cible, la β-D-Glucane synthetase de la paroi fongique. Contexte et objectifs Suite a l’installation en 2010 de l’activite de transplantation hepatique au CHU de Tours, la consommation d’echinocandines en reanimation chirurgicale est passee, en l’espace de 36 mois, de 67 journees de traitement par an a 392. L’objectif de ce travail etait donc d’effectuer une « photographie » locale des mutations apparues sur les hot spots des genes FKS1  et FKS2  de toute souche de C. glabrata isolee en reanimation chirurgicale entre novembre 2013 et avril 2014. Materiel et methodes L’identification mycologique a ete realisee jusqu’a l’espece par les methodes usuelles. L’ADN des souches identifiees comme C. glabrata a ete extrait par le kit QIAmp DNA Mini Kit ® (Qiagen). Les sequences des deux hot spots (HS1 et HS2) des genes FKS1  et FKS2  ont ete amplifiees par PCR (Thompson GR 3rd., et al. AAC, 2008). Les sequences obtenues ont ete alignees (Codon Code Aligner ® ), puis comparees a une sequence de reference (GenBank accession number : AGP03610.1 ). Les CMIs pour la caspofungine ont ete mesurees par technique E-test ® (BioMerieux). Resultats Sur la periode d’etude, 21 souches de C. glabrata ont ete isolees chez 14 patients, dont 42,9 % exposes a la caspofungine (en moyenne, 15,0 jours de traitement ± 6,6). Toutes, sauf une, presentaient des sequences conservees ( wild type ) dans les domaines FKS1  et FKS2 , et quand realisees, les CMIs etaient basses (0,24 μg/mL ± 0,09). Une souche, issue des urines sondees d’une patiente ayant beneficie d’un traitement prealable par caspofungine pendant 21 jours, presentait la mutation F659S sur HS1 du gene FKS2  et une CMI a 1,0 μg/mL. Pour la meme patiente, l’isolat anterieur provenant des urines presentait une CMI a 0,25 μg/mL. Discussion et conclusion Dans notre contexte, ces resultats ne sont pas en faveur de l’emergence large de phenomenes de resistance genetique vis-a-vis des echinocandines. Neanmoins, la detection d’une mutation isolee apparait comme un signal qui devrait nous inciter a une vigilance et une surveillance epidemiologique reguliere.