The long non-coding RNA expression profile of Coxsackievirus A16 infected RD cells identified by RNA-seq

Coxsackievirus A16 (CVA16 ) 是在孩子的手，脚和嘴疾病(HFMD ) 的主要病原体之一。长非编码的 RNA (IncRNAs ) 在各种各样的生物过程被含有，但是他们没与 CVA16 感染被联系。在这研究，我们包括地描绘了正常的 IncRNAs 的风景， CVA16 感染了 rhabdomyosarcoma (RD ) 调查 IncRNAs 的功能的关联的房间使用 RNA-Seq。我们证明 760 IncRNAs 的一个总数是 upregulated， 1210 IncRNAs 是 downregulated。从这些 dysregulated IncRNAs， 43.64% 是 intergenic， 22.31% 是感觉， 15.89% 是 intronic， 8.67% 是双向的， 5.59% 是 antisense， 3.85% 是 sRNA 主人 IncRNAs， 0.05% 是 enhancer。六 dysregulated IncRNAs 被量的 PCR 试金验证，这些 IncRNAs 的第二等的结构被投射。而且，我们进行了 IncRNAs (ENST00000602478 ) 的生物信息学分析阐明修正的差异和 IncRNAs 的功能。在摘要，当前的学习在 CVA16 挑战之上比较了 dysregulated IncRNAs 侧面并且说明了在编码和 IncRNAs 抄本之间的复杂关系。这些结果不能仅仅在 CVA16 提供抄写的一幅完全的图画感染的房间而且为 HFMD 的处理提供新奇分子的目标。