金黄色葡萄球菌肠毒素SEA、SEB、SEC、SED序列多态性及进化分析

目的对不同来源金黄色葡萄球菌肠毒素SEA、SEB、SEC和SED的序列多态性及进化进行分析，为进一步了解不同亚型的毒素表达差异及食品风险评估提供理论依据。 方法选择我国部分地区不同来源经典肠毒素SEA、SEB、SEC和SED阳性的菌株共90株，采用PCR方法扩增其序列并测序。 并与GenBank下载的经典肠毒素亚型代表序列进行比对分析，用MEGA 7软件构建系统发生树。 结果SEA氨基酸序列存在3个突变位点，主要位于N端和C端；有3个亚型，SEA阳性菌株以SEA1亚型为主。 SEB氨基酸序列在两端的突变较中间活跃，存在18个突变位点；有11个亚型，SEB阳性菌株主要为SEB1和SEB2亚型。 SEC氨基酸序列突变位点有24个，分布在整个序列；共8个亚型，SEC阳性菌株以SEC3亚型为主。 SED氨基酸序列相对保守，共7个亚型，SED阳性菌株以SED1为主。 本研究还发现2个新亚型，分别命名为SEB9和SEC5，均来自患者分离菌株。 结论SEA和SED的氨基酸序列较为保守，SEB和SEC的氨基酸突变位点较多。4种肠毒素的氨基酸序列进化树均分为2个分支。 本研究选取的菌株以SEA1、SEB1、SEB2、SEC3和SED1亚型为主。