Estructura poblacional de la tortuga verde (Chelonia mydas) del Gran Caribe, basada en secuencias de DNA mitocóndrico, con énfasis en colonias del suroeste de Cuba/Population genetic structure of Greater Caribbean green turtles (Chelonia mydas) based on

2014 
ABSTRACT Effective conservation management of sea turtles depends on understanding the demographic interconnections between populations. Beginning with the sequencing of 490 bp from the mitochondrial DNA control region, we characterized genetic variation within and between two green turtle (Chelonia mydas) rookeries in southwestern Cuba [N=28] and assessed these data in a regional context to understand the contribution of each rookery to the genetic structure of the species. In the Cuban rookeries, haplotypes belong to the same lineage (II) and 71% of them are endemic but in low frequency. There was no significant genetic structure among Cuban rookeries. However, when compared with the rest of the Greater Caribbean rookeries, some genetic structuring was revealed(AMOVA), with higher variation within than between rookeries. Genetic differentiation (FST) was positively correlated with geographical distances among rookeries. In the Cuban population, a pattern of sudden expansion was supported by the observed mismatch distribution. However, Fu’s test failed to reject the standard neutral model, probably as a consequence of recent migrations. Using a nested clade phylogeographic analysis, restricted genetic flow and isolation by distance for the clade containing most of the Cuban haplotypes was inferred. Among the totally nested clades, past fragmentation and/or long distance colonization was inferred. From these results, the nesting population of southwestern Cuba, although sharing a historical connection with the regional populations, constitutes a separate demographic unit that should be managed independently. Key words : mtDNA control region; population genetic; phylogeography; Chelonia mydas; ASW, Cuba. RESUMEN La conservacion efectiva de las Tortugas marinas depende del conocimiento de las interconexiones demograficas entre las poblaciones. Nosotros caracterizamos la variacion genetica dentro y entre dos colonias de anidacion de tortuga verde (Chelonia mydas) en el suroeste de Cuba [N=28] y evaluamos estos datos en un contexto regional para comprender la contribucion de cada colonia de anidacion a la estructura genetica de la especie, a partir de la secuenciacion de 490 pb de la region de control del DNA mitocondrico. En las colonias cubanas los haplotipos pertenecieron al mismo linaje (II) y el 71% de estos resultaron endemicos, pero con baja representatividad. Entre las colonias de anidacion cubanas no se encontro estructura genetica significativa. Sin embargo, cuando se comparan los datos con las demas colonias del Gran Caribe se encontro estructura genetica significativa (AMOVA), con mayor variacion dentro que entre las colonias de anidacion. La diferenciacion genetica (FST) estuvo positivamente correlacionada con la distancia geografica entre las colonias de anidacion. En la poblacion cubana, un patron de expansion subita fue soportado por una distribucion desigual observada. Sin embargo, El resultado de la Prueba de Fu rechazo el modelo estandar de neutralidad, probablemente como una consecuencia de migraciones recientes. Usando el analisis de clados anidados, se infirio un flujo de genes restringido y un aislamiento por distancia para los clados que contuvieron la mayoria de los haplotipos cubanos. Una fragmentacion pasada y/ o una colonizacion a largas distancia fue inferida entre el total de clados anidados. A pesar de que la poblacion de anidacion del suroeste cubano comparte una conexion historica con las otras poblaciones de la region, constituye una unidad demografica separada que debe ser manejada independientemente. Palabras claves : region de control del mtDNA; genetica poblacional; filogeografia; Chelonia mydas; ASW, Cuba.
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