2014—2015年豫南地区猪流行性腹泻病毒 S 基因变异分析

为分析河南地区猪流行性腹泻病毒（PEDV）的变异情况，本研究设计合成扩增 S 基因全长的引物，利用RT-PCR方法，对2014—2015年采集病料中38株PEDV S 基因进行扩增、克隆和序列测定，并根据结果构建进化树和进行序列比对分析。 S 基因进化树分析表明：所有PEDV S 基因扩增片段与近年来中国和美国分离的变异毒株亲缘关系较近。序列比对分析表明：扩增的PEDV S 基因编码的S蛋白中存在氨基酸的插入和缺失。并且，一些扩增 S 基因片段在编码的S蛋白的C端有11个氨基酸的缺失。许多扩增的 S 基因在编码的S蛋白的中和表位COE和2C10区域存在氨基酸突变。这些结果为了解河南地区PEDV变异流行情况和控制PED的暴发提供了基础研究理论。