Rhizoctonia solani AG-3PT is the major pathogen associated with potato stem canker and black scurf in Colombia

El chancro del tallo y la sarna negra de la papa son ocasionados por el hongo basidiomicete Thanatephorus cucumeris (especie anamorfica compleja Rhizoctonia solani ). Estas dos enfermedades tienen una distribucion global en los cultivos de papa, pero su etiologia local es variable, dependiendo de la predominancia de diferentes grupos de anastomosis (GAs) en una localidad dada. Al interior de esta especie compleja se han encontrado varios GAs asociados con el chancro del tallo y la sarna negra, como GA-1, GA-2-1, GA-2-2, GA-3, GA-4, GA-5 y GA-9. Este articulo es el informe del estudio mas exhaustivo a nivel poblacional realizado en Colombia sobre la distribucion de los GAs de R. solani en lotes comerciales de papa. Se examinaron 433 aislamientos colectados entre 2005 y 2009 en las regiones paperas mas importantes del pais. Los aislamientos fueron asignados a los GAs por PCR usando cebadores especificos para el GA-3 y secuenciamiento del ITS-ADNr e interacciones hifales. El GA-3PT cubrio la mayoria de los aislamientos (88,45 %), el GA-2-1 tuvo el 2,54 % y los aislamientos restantes correspondieron a cepas binucleadas de R. solani (GA-A, -E, y -I). Las pruebas de patogenicidad sobre diferentes plantas, incluida la papa, evidenciaron que el GA-3PT afecta los tallos de las plantas de la familia Solanacea; en otros hospedantes evaluados el dano fue severo en las raices pero no en los tallos; el GA- 2-1 ocasiono chancros en tallos de plantulas de papa y mostaza, y pudricion de raices en otras plantas. Estos resultados indican que el GA-3PT de R. solani es el principal patogeno asociado con las enfermedades del chancro del tallo y la sarna negra de la papa en Colombia. Stem canker and black scurf diseases of potatoes are caused by the basidiomycetous fungus Thanatephorus cucumeris (anamorphic species complex Rhizoctonia solani). These diseases have worldwide distribution wherever potato is grown but their etiology varies depending on the predominance of distinct R. solani anastomosis groups (AGs) in a particular area. Within the species complex, several AGs have been associated with stem canker or black scurf diseases, including AG-1, AG-2-1, AG-2-2, AG-3, AG-4, AG-5 and AG-9. This article reports on the most comprehensive population-based study, providing evidence on the distribution of R. solani AGs in Colombian potato fields. A total of 433 isolates were sampled from the main potato cropping areas in Colombia from 2005 to 2009. Isolates were assigned to AGs by conventional PCR assays using specific primers for AG-3, sequencing of the ITS-rDNA and hyphal interactions. Most of the isolates evaluated were assigned to AG-3PT (88.45%), and a few to AG-2-1 (2.54%). The remaining isolates were binucleate Rhizoctonia (AG-A, E, and I). Pathogenicity tests on the stems and roots of different plant species, including the potato, showed that AG-3PT affects the stems of solanaceous plants. In other plant species, damage was severe in the roots, but not the stems. AG-2-1 caused stem canker of Solanum tuberosum cv. Capiro and in R. raphanistrum and B. campestris subsp. Rapa plantlets and root rot in other plants. The results of our study indicated that R. solani AG-3PT was the principal pathogen associated with potato stem canker and black scurf diseases of potatoes in Colombia.