ANÁLISE COMPUTACIONAL DO SÍTIO ATIVO DA ENZIMA LASPARAGINASE DE Erwinia rhapontici

Introducao: As asparaginases sao amplamente distribuidas na natureza, de bacterias a mamiferos, e desempenham uma funcao central no metabolismo e utilizacao de aminoacidos. Atraves desta enzima a asparagina e hidrolisada em aspartato, que entao e transaminado em oxaloacetato, um intermediario no ciclo de Krebs. Por isso, as asparaginases sao importantes para manter o equilibrio de nitrogenio e os niveis de aminoacidos dentro celulas, niveis estes que sao indispensaveis para o crescimento do organismo. Objetivo: Realizar analise computacional do sitio ativo de asparaginase tipo I de Erwinia rhapontici. Material e metodos: Foi realizada uma busca a partir da sequencia FASTA (genebank id ID: AGB58265.1) da L asparaginase tipo I de Erwinia rhapontici no Protein Data Bank - PDB, para aquisicao de um molde proteico. Posteriormente foi realizado o alinhamento entre as sequencias alvo e molde. Foram construidos cinco modelos proteicos no progama modeller 9v8, sendo estes submetidos a validacao atraves do grafico de Ramachandran, QMEAN, Prosa e ProQ. Resultados: Foi escolhido o PDB 2P2N para ser utilizado como referencia para gerar os candidatos a farmaco, sendo construido diversos modelos, validados e escolhido aquele com melhores resultados. O modelo proposto possui 337 aminoacidos, sendo sua estrutura secundaria caracterizada por 11 ẞ-folhas, 10 α-helices e 21 loops, todos equivalentes as estruturas do modelo de referencia (2P2N). O sitio ativo e composto de diade de treonina nas posicoes 14 e 91 no modelo de referencia em posicoes equivalentes no modelo construido. Conclusao: A partir dos estudos computacionais realizados, mostrou-se que a asparaginase tipo I de Erwinia rhapontici se mantem estruturalmente conservada, sugerindo a garantia da sua funcao no mecanismo catalitico da asparagina, onde participa regulando niveis intracelulares de nitrogenio e aminoacidos celulares. Estudos adicionais de acoplamento e dinâmica molecular devem ser realizados para observar se ocorrem interacoes no complexo enzima-substrato.