Contribution du MALDI-TOF pour l’identification des filamenteux en routine au CHRU de Besançon

Contexte Le MALDI-TOF est maintenant utilise en routine dans une majorite de laboratoires pour l’identification des bacteries et des levures. La place du MALDI-TOF pour l’identification des filamenteux en routine est moins bien definie. Objectif Evaluer la capacite du MALDI-TOF a identifie les filamenteux en routine en utilisant la database « Fungi » BRUCKER, specifiquement dediee a l’identification des filamenteux. Methodes Une serie de 46 souches de filamenteux, initialement identifies par microscopie, a ete testee par MALDI-TOF apres culture liquide et extraction longue, comme cela est recommande par le fournisseur. Resultats (1) Vingt-deux de dermatophytes ont ete testees : 9  Trichophyton rubrum , 6  T .  mentagrophytes , 3  T .  tonsurans , 1  T .  soudanense , 1  Epidermophyton floccosum , 1  Microsporum persicolor et 1  M .  gypseum . Seules les souches de T .  rubrum et la souche de M .  gypseum ont ete identifiees avec succes. Pour E .  floccosum , le commentaire « pas d’identification possible » a ete obtenu. Pour T .  tonsurans , T .  mentagrophytes et M .  persicolor , un resultat d’espece errone, essentiellement T .  equinum et M .  canis , avec un tres bon score (> 2) a ete obtenu. (2) Vingt-quatre souches de filamenteux non dermatophytes ont ete testees : 7 Mucorales (2  Lichtheimia corymbifera , 2  Mucor sp., 1  Rhizopus oryzae , 1  Rhizomucor sp., 1  Cunninghamella bertholettiae ), 6  Aspergillus sp. (2  A .  flavus , 1  A .  nidulans , 1  A .  terreus , 1  A .  ochraceus , 1  A .  glaucus , 1  A .  versicolor ), 7  Fusarium sp. (4  F .  solani , 2  F .  proliferatum , 1  F .  oxysporum ), 1  Scytalidium dimidiatum , 1  Scopulariopsis brevicaulis , 1  Scedosporium apiopsermum . Les Fusarium sp. ont ete identifies a l’espece dans tous les cas. Les Mucorales ont ete identifiees au genre dans tous les cas, et a l’espece dans un cas sur deux. Les Aspergillus sp. ont ete identifies a l’espece a l’exception de A .  glaucus (qui n’est pas dans la database). La souche de S .  brevicaulis a ete bien identifiee. Le commentaire « aucune identification possible » a ete obtenu pour les S .  dimidiatum et S .  apiospermum , pourtant presents dans la database. Aucun resultat d’espece errone n’a ete obtenu pour les filamenteux non dermatophytes. Discussion Le MALDI-TOF peut rendre service en routine au laboratoire, essentiellement pour l’identification a l’espece rapide des Fusarium sp., des Mucorales et de certains Aspergillus sp. La plus grande prudence doit etre appliquee en cas d’identification de dermatophytes par MALDI-TOF, ou la microscopie, et le sequencage si besoin, doivent etre privilegies. De meilleurs resultats pourraient etre obtenus par enrichissement de cette database par l’ajout de spectres de references pour des especes pour l’instant peu voire pas representees par le fournisseur.