Farklı Metotlar Kullanılarak Elde Edilen Aynı Miktar Bakteriyel DNA’lar Arasındaki Konsantrasyon Farklılıklarının Belirlenmesi

Bu calismada kulture alinmis olan  L. garvieae  izolatlari ayni besiyeri (TSA) ve miktari (20ml) ile ayni cevresel sartlarda (7,4 pH, 21 o C, 24 saat) inkube edilmistir.  Izolatlarin identifikasyonlari Real-Time PCR ile 16S rRNA gen bolgesine spesifik primer assay ile teyit edilmistir. 24 saatlik inkubasyon periyodunun ardindan 10ml’lik TSB besiyerinde gelisen izolatlar 600 nm dalga boyunda 1.0 OD’ye esitlenmistir. Farkli gruplardan DNA izolasyonlari; sivi besiyerinde kaynatma, kati besiyerinde (Esit OD) kaynatma, 2 farkli ticari kit kullanilarak manuel izolasyon ve otomatik izolasyon robotu olmak uzere toplam 5 farkli metotla gerceklestirilmistir. Izole edilen DNA’larin ve gerceklestirilen Real-Time PCR isleminin ardindan izolasyon robotu ile elde edilen sonuclarda DNA kalitesinin en iyi oldugu, bunu takiben ticari kitler, sivi besiyeri izolasyonu ve kati besiyeri izolasyonlari oldugu gorulmustur. Real-Time PCR grafiginde, calisma gruplari arasindaki tekerrurler icerisinde en buyuk sapma sivi besiyeri izolasyonu ve ticari kit izolasyonunda gozlenmistir.