1992--2008年深圳HIV-1CRF01_AE重组株的流行趋势与进化规律

2011 
目的了解HIV-1CRF01_AE重组株在深圳地区的流行情况,并分析其流行趋势及进化规律。方法收集深圳地区1992--2008年HIV确认阳性血液样本489份,应用巢式聚合酶链反应(Nested-PCR)技术,对样本膜蛋白(Env)基因进行扩增,并对其基因区核苷酸序列进行测定,判定亚型结果。对获得的CRF01_AE重组株核酸序列进行系统进化分析,并计算基因离散率。结果共有465份样本获得分型结果,其中CRF01_AE重组株样本300份(占64.5%)。1992-1999、2000—2005和2006--2008年3个时间段CRF01_AE重组株所占比例分别为56.8%(21/37)、68.4%(78/114)和64.0%(201/314);在这3个时间段内,经异性性传播的比例分别为52.4%(11/21)、43.6%(34/78)和45.8%(92/201),经同性性传播的比率上升明显,分别为4.8%(1/21)、0.0%(0/78)和22.4%(45/201),经吸毒传播的比例分别为19.0%(4/21)、51.3%(40/78)和30.8%(62/210)。系统进化分析发现,不同时间段的样本出现明显的时间聚集现象,并伴有传播途径的聚集及交叉感染现象。各时间段CRF01_AE重组株组内基因离散率分别为(8.783±4.717)%、(11.054±7.141)%、(13.218±4.080)%,有明显的增大趋势。结论HIV-1CRF01_AE重组株是深圳地区的主要流行株,主要经异性性行为、同性恋和吸毒人群传播,随着时间的推移毒株变异程度逐渐增大。
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