СВОЙСТВА НОВОГО D3-ПОДОБНОГО БАКТЕРИОФАГА PHIPMG1 PSEUDOMONAS AERUGINOSA: СТРУКТУРА ГЕНОМА И ПЕРСПЕКТИВЫ ИСПОЛЬЗОВАНИЯ ФАГА В ФАГОТЕРАПИИ

2012 
Приведены результаты изучения нового вирулентного фага phiPMG1, активного на бактериях вида Pseudomonas aeruginosa. Показано, что phiPMG1 проявляет значительную гомологию и сходство в общей структуре генома с умеренным конвертирующим фагом D3. Фаг phiPMG1 отличается от D3 тем, что не способен осуществлять стабильную лизогенизацию и растет на штаммах с плазмидами, подавляющими развитие фага D3 и некоторых других фагов. Это понижает вероятность горизонтального генетического переноса фагом phiPMG и делает возможным его использование в фаготерапии. Сравнение структуры геномов фагов phiPMG1 и D3 выявило не только значительную гомологию 65 генов, но и присутствие в геноме phiPMG1 16 генов, не представленных в базе данных NCBI. Мы предполагаем, что эволюция геномов фагов этого вида в значительной степени связана с миграциями в другие виды бактерий и рекомбинациями с фагами других видов (например, F116). Подробный анализ структуры одной из областей геномов, в которой проявляется существенная негомология у трех D3-подобных фагов (D3, phiPMG1 и PAJU2), показал, что возможно геном phiPMG1 ближе других к геному гипотетического предкового фага этого вида.
    • Correction
    • Source
    • Cite
    • Save
    • Machine Reading By IdeaReader
    0
    References
    0
    Citations
    NaN
    KQI
    []