La taille efficace d’un nématode phytoparasite chez son hôte sauvage

2014 
La taille efficace est un parametre essentiel en genetique des populations, puisqu'il reflete l'impact de la derive sur la diversite genetique. En agronomie, elle joue un role determinant dans l’efficacite de la lutte genetique : les resistances deployees exercent de fortes pressions de selection sur les parasites vises et risquent d’etre contournees si les tailles efficaces sont suffisamment importantes. L'objectif de cette etude est de determiner la taille efficace de populations d' [i]Heterodera schachtii[/i] , un nematode parasite de la betterave. Pour l’evaluer, nous avons utilise la variation temporelle des frequences alleliques de 8 locus microsatellites a partir de deux prelevements successifs, realises a un an d’intervalle, dans le milieu sauvage, ou l’enchainement des generations n'est pas interrompu par les successions culturales. Le nombre de generation produit par [i]Heterodera schachtii[/i] entre les deux periodes d’echantillonnage a ete estime entre 4 et 10, et nous avons donc effectue les calculs de taille efficace pour un ecart suppose de 4, 7 et 10 generations, 7 etant la plus realiste. Un nombre non negligeable de nos populations presentaient des tailles efficaces infinies, ce qui est le signe d'une absence de variation. Nous avons pu associer ce resultat a une production trop faible de nouvelles generations pour ces populations, probablement liee a la mort des plantes parasitees. Les autres populations presentaient des tailles efficaces finies comprises entre 20 et 300 individus, avec une distribution centree autour de 74. Cette valeur est tres faible par rapport au nombre potentiel d'individus dans les populations. Cette faiblesse peut etre reliee a la forte consanguinite observee dans ces populations et aux importantes fluctuations d'effectifs. Les niveaux de consanguinite sont equivalents et les fluctuations d'effectifs plus fortes en milieu cultive, mais ce milieu est aussi caracterise par des flux de genes, notamment d'origine anthropiques, plus importants. Nous discuterons des implications de ces resultats pour la durabilite des resistances utilisees pour la lutte genetique.
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