Contribution du GeneXpert dans le diagnostic de la tuberculose à l’hôpital de la Paix de Ziguinchor
2020
Introduction Le Genexpert MTB/RIF (Xpert) est un test moleculaire unitaire qui permet la detection rapide dans les prelevements cliniques des fragments d’ADN du genome des mycobacteries du complex tuberculosis et eventuellement leur resistance a la rifampicine en 2 heures. Trois ans apres sa mise en place dans notre structure, nous avons realise ce travail pour apprecier sa rentabilite sur les prelevements provenant de toute la zone sud du Senegal. Methodes Nous avons mene une etude retrospective sur les resultats du GeneXpert realises sur les prelevements pulmonaires et extra pulmonaires soumis au laboratoire de mycobacteriologie de l’hopital de la Paix du 1er janvier 2015 au 31 decembre 2018. Resultats Durant cette periode, 2174 GeneXpert ont ete realises. Nous avons note une predominance masculine avec 57,49 % (n = 1249) soit sex-ratio de 2,79 en faveur des hommes. L’âge moyen etait de 41 ± 19 ans avec des extremes 1 et 96 ans. La majeure partie des prelevements recus au laboratoire etaient d’origine pulmonaire avec un total de 1582 (73 %), contre 592 (27 %) pour les prelevements extrapulmonaires. Le Genexpert etait positif dans 25,94 % (n = 574) des prelevements pulmonaires. Le test etait positif pour 47/146 prelevements de liquide de tubage gastrique, pour 26/153 liquides de ponction pleurale, pour 27/30 prelevements de pus, 3/44 LCR, 0/3 liquides de ponction pericardique et 7/102 liquides de ponction d’ascite. Le taux de resistance a la rifampicine etait de 0,91 % (n = 20). Une co-infection TB/VIH etait retrouvee chez 126 patients. Conclusion Le geneXpert reste un outil particulierement rentable dans le diagnostic de la tuberculose pulmonaire et du depistage precoce de la resistance a la Rifampicine surtout en milieu decentralise.
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